بعد از باخت پرسپولیس به الهلال عده‌ای از هواداران پرسپولیس از كریم باقری خواستند بین تیم ملی و پرسپولیس یكی را انتخاب كند.
به گزارش رادیو ورزش،اسكوچیچ چند ماه قبل در مصاحبه‌ای گفته بود من تا روزی كه در ایران هستم حتما از كریم باقری در كادر فنی تیم ملی استفاده می‌كنم. از طرفی باقری با پرسپولیس و تیم ملی قرارداد رسمی دارد و باید به این قراردادها پایبند باشد.
طی روزهای گذشته هیچ بحثی مبنی بر كناره گیری باقری از تیم ملی مطرح نشده و كریم به اسكوچیچ قول داده حتماً برای بازی با لبنان كه در خانه حریف برگزار می‌شود، درست مثل بازی‌های قبلی خود را به اردوی تیم ملی برساند.
در واقع باقری خیال سرمربی كروات تیم ملی را راحت كرده و اسكوچیچ می‌داند كه آقا كریم او را تنها نمی‌گذارد.
خیلی‌ها عقیده دارند كریم باقری در تیم ملی و پرسپولیس بیشتر نقش مدیریتی دارد تا فنی و حضورش روی نیمكت لازم است.
البته مشخص نشد چرا بعد از بازی پرسپولیس و الهلال از گل محمدی كمتر انتقاد شد و همه جور دلیل برای باخت نماینده كشورمان مطرح كردند به جز دلایل فنی كه به شخص سرمربی برمی‌گشت.
